学校是国家首批获得博士、硕士学位授予权的单位，近年来，学校坚持以建设“世界一流学科”为引领，以药学学科的发展带动学校学科建设水平的整体提升，根据学科发展差异化的现状，确立“巩固优势学科、发展特色学科、扶持新兴和交叉学科”的基本策略，主动服务国家和地区重大需求，突出培养一流人才、产出一流成果，找准不同学科的发展定位，引导各学科办出特色和水平。现有博士后流动站2个（药学、中药学），一级学科博士学位授权点2个，专业学位博士点2个，二级学科博士学位授权点21个，一级学科硕士学位授权点8个，二级学科硕士学位授权点58个，专业学位硕士授权点3个。药剂学为国家重点二级学科，中药分析学为国家中医药管理局重点学科，中药分析学和中药药理学为辽宁中医药管理局重点学科；获批辽宁省“建设一流大学”，药学、中药学分别获批辽宁省重点建设“世界一流学科”和“国内一流学科”；在辽宁省新一轮“双一流”建设中，药学、中药学2个学科分别再次入选“世界一流学科”和“国内一流学科”建设对象。生物医药学科群入选首批辽宁省高校优势特色学科群。
学校学科布局合理，特色鲜明，学术影响力不断提升。药理学与毒理学、化学、临床医学、材料科学、农业科学和生物学与生物化学6个学科进入ESI全球前1%，其中，药理学与毒理学世界排名第45位，进入全球前万分之3.28，是辽宁省属高校中排名最高的学科；学校进入全球前0.17%，世界排名1674位。在2024 USNews世界大学学科排名中，学校世界排名1754位，药理学与毒理学世界排名40位。2023年全球学者学术影响力排行榜入选10人，在中国药学领域排名第一；2024全球前2%顶尖科学家排行榜入选23人，在辽宁省属高校中排名第1。2位学者首次进入科睿唯安全球高被引科学家名单，入选人数居中国内地高校第76位（全国165所高校入选1089人，医药类院校并列第三）；7名学者入选爱思唯尔（Elsevier）2024年“中国高被引学者”(Highly Cited Chinese Researchers)榜单，入选总人数在辽宁省属高校中名列前茅。（更新于2025年7月）
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