沈阳药科大学工商管理学院始建于1981年8月20，其前身为沈阳药科大学制药系医药企业管理教研室，从事的主要教学工作是医药企业管理干部专修班教育和短期培训工作。1987年建系，同年开始招收全日制本科生，所设专业为企业管理。1995年10月6日正式建院。学院从1994年开始招收药事管理硕士研究生（挂靠药剂学科），到2006年6月，已毕业11届毕业生。从2001年开始，经省教委批准，我院正式设立企业管理硕士点，这是当时全国唯一的一个药事管理类硕士点。2000年开始招收药事管理博士研究生（挂靠药剂学科）。全国最早的药事管理博士毕业于我院。